台灣的海域面積為陸域面積的6倍，擁有豐富的海洋資源；墾丁國家公園更是我國七座國家公園中，第一個規劃涵蓋海域的國家公園。「珊瑚礁」是恆春半島生態系中最重要的主角，在200公尺深的大陸棚之潮間帶孕育出無限的生態多樣性。墾丁公教會館建築設計讓旅館扮演如珊瑚礁般共生體系的主角，創造與墾丁國家公園以及屏東大生態系的交流，有機共存。

基地保留現有小葉南洋杉、木棉花、鳳凰花；中庭榕樹保留與植栽為調節微氣候降溫，防風林保留則可阻擋落山風與噪音、降低會館環境溫度。建築物外牆保留墾丁特有、由基地內開挖之咕咾石，以箱型石籠方式再利用於入口牆面與景觀圍牆。陽台遮棚系統採用模矩化法拉利布，並融入珊瑚礁的繽紛色彩展現熱帶海洋意象；游泳池下方的接待大廳挑空，引入自然光線與海洋色調。